Основными направлениями его деятельности являются организация и проведение научных исследований, проведение научных, методических семинаров и конференций, издание научного электронного журнала, подготовка заявок на конкурсах грантов; подготовка научных кадров и научное сотрудничество с ведущими учеными Байкальского региона.
Созданию Института предшествовала заключение Бурятским государственным университетом и Забайкальским государственным университетом в мае соглашения о научно-исследовательском, методическом и образовательном сотрудничестве.
Сейчас завершается работа по созданию сайта Института экономических исследований. Создан и проходит регистрацию на получение номера ISBN электронный научный журнал. Также поданы заявки на конкурс грантов Российского гуманитарного научного фонда, сообщает пресс-служба БГУ.